Dịch bệnh viêm màng não do não mô cầu và viêm não Nhật Bản thường lưu hành vào mùa hè, nhưng trong những năm gần đây, hai dịch bệnh này không còn theo mùa mà xuất hiện rải rác quanh năm.
Tại Việt Nam, bệnh viêm màng não do não mô cầu (viêm não mô cầu) lưu hành ở nhiều nơi, phát triển mạnh khi thời tiết lạnh, khô hay trong môi trường đông đúc, ẩm thấp. Bệnh xuất hiện rải rác nhưng có thể gây thành dịch.
Trong tháng 1/2012, cả nước đã có 9 ca bệnh viêm màng não do não mô cầu tại 5 địa phương, trong đó có TP Hồ Chí Minh, Hà Nội, Bình Dương… Đặc biệt, tại Quảng Trị mới đây đã có một bệnh nhi tử vong nghi do căn bệnh này gây nên.